Плата за негативное воздействие на окружающую среду вносится по месту государственного учета стационарного источника загрязнения в том случае, когда стационарный источник загрязнения расположен на территории одного субъекта Российской Федерации, но фактически негативное воздействие на окружающую среду оказывается им на территории другого субъекта Российской Федерации.
Данная позиция отражена в Письме Федеральной службы по надзору в сфере природопользования от 19 июня 2020 г. «О рассмотрении обращения».